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干货分享 | DNA凝胶回收总踩坑?操作步骤及常见问题解析看这里

干货分享 | DNA凝胶回收总踩坑?操作步骤及常见问题解析看这里

发布日期:2026-03-19

在分子生物学研究领域,基因克隆、基因表达分析、PCR产物验证等实验对DNA样本的纯度与完整性要求较高。

DNA凝胶回收作为获取高纯度目标DNA片段的关键技术,

其标准化操作流程与实验耗材的选择,对后续实验的顺利开展具有重要影响。

从样本预处理、DNA吸附洗脱到杂质去除的每个环节,不仅需要科学严谨的操作步骤,还需优质的适配实验耗材,

以有效降低样本损失与外源污染风险。爱津生物纯化柱凭借其可靠的性能表现,可

在DNA凝胶回收流程中发挥重要作用,为科研工作者提供实验支持。


01  实验原理剖析

PCR扩增产物经过琼脂糖凝胶电泳后,按分子量大小被分开,排列在凝胶中,跟DNA Marker分子量的对比下,

找到目的DNA带所在的凝胶,并把它切下来,加热或用特殊的试剂熔解凝胶,

使DNA溶回到溶液中,再经过乙醇沉淀或过柱即可获得目的DNA片段。


02  实验操作流程


① 样本预处理与结合缓冲液混合

将PCR反应混合物转移至1.5mL微量离心管,按1:3比例加入Binding Buffer I。

② DNA吸附与初步离心

将纯化柱置于一个2mL收集管中,将上一步骤的混合液转移至纯化柱中,

室温竖直放置2分钟,随后以8000 rpm的转速离心1分钟。

③ 首次洗涤杂质去除

弃去收集管中的液体,向纯化柱中加入500μL Wash Solution,12000 rpm离心1分钟,

弃去收集管中的液体,将纯化柱放回原来的收集管中。爱津纯化柱可提供装配优质玻璃纤维膜,

在洗涤过程中既能高效截留DNA,性能稳定,重复性好,确保DNA纯度。


④ 二次洗涤深度净化

再次添加500μL Wash Solution到纯化柱中,12000 rpm离心1分钟。弃去收集管中的液体,

随后再次离心,去除残留的Wash Solution。

⑤ DNA洗脱与保存

将纯化柱转移至干净的1.5mL微量离心管,在纯化柱膜中央加入30 - 50μL Elution Buffer,50℃温浴2分钟。

12000 rpm离心1分钟,将PCR产物置于-20℃冷冻保存或立即试用。

爱津纯化柱可实现轻松单手开合,且密封性强,有效避免样本在操作过程中受到污染。


03  常见问题深度剖析与解决方案

① 目的产物回收率低

问题原因

▪ 紫外灯下切胶操作耗时过长,导致核酸长时间暴露于紫外辐射,

分子结构可能发生变化,从而失去功能;

▪ 电泳时所使用的缓冲液长期未更换,pH值发生改变,影响DNA吸附。

解决方法

▪ 优化切胶流程,缩短紫外照射时间;

▪ 定期更换电泳缓冲液,确保其pH值处于适宜范围。


② 洗脱效率低

问题原因

▪ 洗涤步骤后,残留乙醇未充分挥发,阻碍DNA从纯化柱膜上洗脱;

▪ Elution Buffer未准确滴加至膜上,导致DNA溶解不充分。

解决方法

▪ 溶液转移至纯化柱加入Wash Solution离心两次后,需将装有纯化柱的管盖打开静置,

使残留乙醇充分挥发;

▪ 添加Elution Buffer时,必须确保缓冲液直接滴在膜上。


③ 琼脂糖凝胶未完全融化

问题原因

▪ 55℃水浴溶胶过程中,凝胶未充分混匀,导致局部未完全溶解;

▪ 胶块体积过大,不仅会降低溶胶效率,导致溶液pH值异常,

还可能使溶液颜色发生改变。

解决方法

▪ 溶胶时多次上下颠倒使凝胶充分融化混匀,确保无固体琼脂糖残留,胶溶化后,一般情况下,

将呈现淡黄色或几乎无色;

▪ 若胶块过大,可适当增加溶胶液用量,直至溶液颜色恢复正常。


④ 凝胶切块过大

问题原因

未精准切除不含目的片段的琼脂糖凝胶,导致凝胶体积过大,增加后续处理难度,

影响DNA回收率与纯度。

(左侧为合适大小的胶块,右侧为体积过大的胶块)

解决方法

仔细辨别目的条带,尽可能切除多余凝胶,减小凝胶体积,提高 DNA回收效率与纯度。


⑤ 外源DNA污染

问题原因

实验环境清洁度不达标,操作过程未严格遵循无菌操作规范,导致外源DNA混入样本。

解决方法

确保实验在洁净环境中进行,严格执行无菌操作流程,减少外源DNA污染风险。


04 注意事项

① 试剂使用规范

要严格按照试剂盒说明书操作,例如Wash Solution中是否需要加入一定体积的无水乙醇,

体积数目根据试剂盒试剂要求而定等。

② 安全防护措施

核酸染料多具有潜在毒性,操作过程中需佩戴手套、护目镜等防护装备,

规范处理废弃物,避免环境污染与人体伤害。


05 相关产品推荐-爱津纯化柱

在DNA凝胶回收实验常遇回收率不理想、样本易受污染等情况时,

爱津纯化柱以多项性能优势,为实验顺利开展提供可靠支持。

▪ 采用符合USP Class VI标准的进口高分子聚丙烯(PP)材质,无热原、

无内毒素、无DNase/RNase;

▪ 壁厚均匀,高速离心不爆管,安全可靠;

▪ 可承受高速离心,最大离心力可达24000xg;

▪ 高精度模具生产,无表面涂层,不会污染样品;

▪ 可轻松单手打开和关闭,密封严实;

▪ 可提供装配优质玻璃纤维膜,提取得率高,性能稳定,重复性好,

适用于PCR、酶切、测序、杂交等各种实验操作。


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END


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